Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms