Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC52A3Q9NQ40 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms