Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE7BQ9NP56 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms