Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms