Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms