Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms