Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2J2Q9GZM3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms