Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP74Q9C0B2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms