Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms