Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms