Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms