Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms