Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms