Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT140Q96RY7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT140Q96RY7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT140Q96RY7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT140Q96RY7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT140Q96RY7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms