Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms