Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL15Q96M94 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms