Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms