Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BICD1Q96G01 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms