Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
EFHD2Q96C19 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFHD2Q96C19 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms