Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCAMP4Q969E2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCAMP4Q969E2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms