Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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