Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAIQ8N9R8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms