Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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