Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C10orf53Q8N6V4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C10orf53Q8N6V4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C10orf53Q8N6V4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C10orf53Q8N6V4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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