Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms