Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG9AQ7Z3C6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms