Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TCF23Q7RTU1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms