Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP43Q70EL4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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