Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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