Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms