Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF628Q5EBL2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms