Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms