Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL12Q53G59 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms