Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms