Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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