Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms