Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC57Q2TAC2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms