Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL24A1Q17RW2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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