Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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