Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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