Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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