Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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