Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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