Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms