Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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