Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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