Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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