Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCEA2Q15560 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms