Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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