Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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